Делал плагин для JIRA. Запихнул сурцы в Dropbox, снёс систему, переставился, синхронизировался.

Открываю проект в NetBeans — а он мне — Mailformed Maven Project. Download deps ни к чему не привели.

Решение проблемы — это JIRA SDK. Качаем, ставим в PATH папку bin, и из папки сурцов плагина делаем atlas-run. Он подсосёт всё необходимое для системы самостоятельно.